Это направление гидрографической деятельности имеет два главных направления: выполнение гидротехнических, главным образом дноуглубительных работ в прибрежной зоне и обеспечение выполнения геологической съемки на шельфе. Последнее направление стало актуальными в последние 20-30 лет в связи с повышением интенсивности хозяйственной деятельности в прибрежной зоне и необходимостью получения дополнительной информации и рельефе дна и составе донного грунта на конкретной акватории с целью обеспечения промышленной добычи полезных ископаемых.Все возрастающее практическое значение в настоящее время приобретают высокоточные съемки прибрежных акваторий, связанные с обеспечением безопасности судов, дноуглублением, гидротехническим строительством. Сегодня администрация порта или дноуглубительная компания не может эффективно работать без использования современного гидрографического оборудования. Объем предстоящих дноуглубительных работ и текущее состояние дна акватории после выполнения очередного дноуглубления требует точной и оперативной информации. Большинство ЭГИС имеют в своем составе специализированные модули, обеспечивающие работу дноуглубительных судов. Так в ЭГИС «Hypack МАХ» имеется пакет программ «DredgePack», обеспечивающий поддержку выполнения дноуглубления в реальном масштабе времени. Аналогичные возможности обеспечивают ЭГИС QINSy. Крупные дноуглубительные компании, такие как «Baskalis Bv» создали собственное программное обеспечение для гидрографической поддержки дноуглубления и расчета объемов извлекаемого материала.
Гидрографические съемки для обеспечения прибрежных инженерных работ производятся, как правило, в составе морских геолого-геофизических исследований шельфа, а также для съемок, позволяющих осуществить проектирования прокладки инженерных коммуникаций (трубопроводов, кабелей и.т.д) на морском дне. Высокоточная съемка рельефа является необходимым этапом выполнения подобных работ.
Особенностью данной съемки является необходимость получения информации о структуре поверхности морского дна, а также структуре верхнего слоя донных осадков.
Для выполнения таких съемок обычно используется аппаратурно- программный комплекс, содержащий однолучевой двухчастотный эхолот (38 и 200 кГц), МЛЭ, ГБО, а также низкочастотный эхолот- профилограф с частотой 3-5 кГц, а также сейсмические методы съемки. Для поддержки профилографа применяется, как правило, отдельное программное обеспечение. Для инженерных изысканий (проектирование коммуникаций) достаточна глубинность изучения осадка до 30-50 м., которая обеспечивается низкочастотным эхолотом профилографом.. При этом подробность получения вертикальной структуры осадка может составить 0.2- 0.4 м.
Для геологического изучения акватории в аппаратурно-программный комплекс может быть дополнительно включен буммер (частота менее 1 кГц) или легкий сейсмический комплекс (частоты 600 – 800 Гц с сейсмокосой длинной 200-400 м.), что обеспечивает повышение глубинности разреза (до 200-400м.), однако понижает подробность (возможность получения разрешения по слоям донных осадков) до 2-5 м.