Необходимо отметить, что реализация программы импортозамещения имеет серьёзные проблемы. Данная экономическая реформа требует масштабных инвестиций. На выполнение программы импортозамещения до 2020 года потребуется 2,5 трлн рублей частных и государственных средств. В условиях отсутствия внешнего финансирования, главным источником инвестиций теперь будут внутренние ресурсы, прежде всего федеральный бюджет и резервы страны.
Проблемой также является отсталость производственной базы отечественных предприятий. В станкостроении и тяжелом машиностроении импорт находился на уровне 70-90%, следовательно, производство в России снизилось.Потребители не доверяют отечественному производителю, поскольку качество продукции находится на низком уровне. В медицине большая доля антибиотиков изготавливается из импортного сырья, так как в России нет условий для их производства. Существует еще одна немало важная проблема. Большая часть промышленных предприятий (57%) не смогут или не планируют переходить на отечественные машины и оборудование, сырье и материалы, опасаясь, что качество продукции снизится, а цены вырастут. Обобщив вышесказанное, необходимо отметить, что успешная реализация программы импортозамещения к 2020 году должна привести к торговой независимости России от стран ЕС и США, развитию внутреннего производства и товарооборота, снижению уровня инфляции, увеличению количества построенных заводов и открывшихся предприятий, а также подъему экономики в целом. Однако очевидно, что для реализации такой масштабной программы, как программа импортозамещения потребуется большое количество времени. В долгосрочной перспективе успешное импотозамещение возможно за счет инноваций, стимулирования инвестиций в технические отрасли и создания новых производств в регионах.