Возможны два типа поглощения металлов микроорганизмами: первый включает неспецифическое связывание катионов на поверхности клеток, в слоях слизи, на внеклеточных матрицах и т.д.; второй представляет собой внутриклеточное поглощение, зависящее от метаболического процесса. Полигалактуроновая кислота, обычный компонент внеклеточного слизистого слоя клеток бактерий, может связывать в комплексы различные микроэлементы. Микробиологическая аккумуляция микроэлементов имеет большое значение как для круговорота микроэлементов в почве, так и для доступности их растениям. Грибы и актиномицеты наиболее устойчивы к высоким концентрациям тяжѐлых металлов среди микроорганизмов, а нитрифицирующие микроорганизмы и микроорганизмы ризосферы –самые чувствительные.