Эффекторные нервные окончания передают нервные импульсы от эффекторных нейронов рабочим органам (мышцы, железы). Соответственно, они бывают двух типов – двигательные и секреторные. Двигательные нервные окон­чания – концевые аппараты двигательных нейронов (мото­нейронов), которые оканчиваются на мышце. Двигательные окончания в поперечно-полосатых мышцах называются нервно-мышечными окончаниями. Они состоят из концевого ветвления осевого цилиндра нервного волокна (пресинаптическая часть) и специализированного участка мышечного волокна (постсинаптическая часть). Миелиновое нервное волокно, подойдя к мышечному волокну, теряет миелиновую оболочку и погружается в мышечное волокно, вдавливая его сарколемму. Плазмолемма покрывающая ветвления аксона является пресинаптической мембраной, а сарколемма, покрывающая в этом участке мышечное во­локно, становится постсинаптической мембраной. Между ними расположена синаптическая щель шириной около 50 нм. В терминальных ветвлениях аксона расположены много­численные пресинаптические пузырьки, содержащие ме­диатор ацетилхолин. При прохождении по аксону нервного импульса ацетилхолин выделяется в синаптическую щель и действует на холинорецепторы постсинаптической мем­браны. Это вызывает деполяризацию постсинаптической мембраны, которая передаётся по Т-трубочкам на всю тол­щину мышечного волокна и достигает цистерн саркоплазма­тической сети. Из них выделяются ионы кальция, под дейст­вием которых происходит взаимодействие между актино­выми и миозиновыми нитями и сокращение мышечного во­локна. После этого ацетилхолин быстро разрушается фер­ментом ацетилхолинэстеразой, расположенной в постси­наптической мембране.
Двигательные нервные окончания на клетках глад­комышечной ткани представляют собой многочисленные чёткообразные (варикозные) утолщения аксонов мотонейро­нов, содержащие пресинаптические пузырьки с ацетилхоли­ном или норадреналином. Здесь нет ограниченных синапти­ческих образований, содержащих активные зоны, опреде­ляющие точные места выхода нейромедиатора. Кроме того, эти утолщения не прилегают к каким-либо специализирован­ным рецептивным участкам постсинаптической клетки. Вме­сто этого медиатор диффундирует в широких пределах, воз­действуя сразу на рецепторы нескольких клеток, располо­женных вблизи, паракринным способом (подобно местным гормонам).
Аналогичным образом построены и работают секретор­ные нервные окончания на железистых клетках.
Эффекторные окончания на поперечнополосатой мус­кулатуре обычно образуются нейронами двигательных ядер передних рогов спиннного мозга или ствола головного мозга, а эффекторные окончания на гладкомышечных и секретор­ных клетках – нейронами вегетативной нервной системы.