Причиной развития дефицита витамина В12 в отдельных случаях является его дефицит в пище: у лиц с вегетарианским питанием, при вскармливании детей матерями-вегетарианками, а также при синдроме мальабсорбции, который включает нарушение всасывания витамина В12. Дефицит ВФ может наблюдаться при частичной или тотальной гастрэктомии; при синдроме «слепой петли» в связи с размножением бактерий, которые потребляют витамин В12 в тонком кишечнике.
Паразитирование широкого лентеца в кишечнике может вызвать мегалобластную анемию вследствие конкурентного потребления витамина В12, которое проходит только при удалении паразита.
Наследственные формы В12-дефицитной анемии К ним относятся: 1. наследственное нарушение секреции ВФ; 2. нарушение всасывания витамина В12 в кишечнике (синдром Имерслунд – Гресбека); 3. наследственный дефицит транскобаламина II.